性格がまったくちがう２人のキュートな女子中学生が、プリキュアに変身！
滅びの力で支配しようとするアクダイカーンらに立ち向かうお話。

２代目のプリキュアの名前は、キュアブルームとキュアイーグレット。

キュアブルームは、中学２年生のふつうの女の子。名前は、日向 咲（ひゅうがさき）。
キュアイーグレットは、咲と同じ中学２年生。名前は、美翔 舞（みしょうまい）。

咲と舞が、ふとしたことから、花の精・フラッピと鳥の精・チョッピに出会い、プリキュアに変身するパワーを手に入れる。
フラッピとチョッピは、「泉（いずみ）の郷（さと）」と呼ばれる、精霊の国からやってきた使い。フラッピたちが暮らす「泉の郷」には、７つの泉があり、それを精霊たちが大切に守ってきた。

だけど、滅びの力で世界を支配しようとつよくねがっているアクダイカーンらの攻撃を受けて、「泉の郷」の７つの泉のうち、６つが奪われてしまった！そして大切な木・世界樹、が枯れてしまいそうになっている。世界樹が枯れると、「泉の郷」だけでなく、咲と舞が住む、「緑の郷」（地球）の生物もみんな死んでしまう・・・。

咲と舞は、フラッピとチョッピからパワーをもらってプリキュアに変身、キュアブルームとキュアイーグレットになって、アクダイカーンの手下たちと、「泉の郷」と「緑の郷」を守るために闘っていく。